Gaussian 16 Linux

February 11, 2020, 10:08 am

9.1/ 10stars

vanmadenti.tk

 

 


Gaussian - Technická dokumentace 1. 0 dokumentace Technická dokumentace Gaussian je program pro modelování elektronických struktur, který společnost Atlas licencovala pro své klastry HPC, které podporují sadu pokynů AVX2 (aktuálně Atlas. Chcete-li zobrazit dostupné verze Guassiana v klastru, spusťte: modul pavouk Gaussian. Gaussian: Verze: Gaussian / 09 Gaussian / 16 Podrobné informace o konkrétním modulu „Gaussian“ (včetně způsobu načtení modulů) použijte celé jméno modulu. Například: modul pavouk Gaussian / 16 Než se však pokusíte spustit Gaussian, ujistěte se prosím, že váš uživatel patří do skupiny Unix g09 nebo g16. Pokud tomu tak není, pošlete e-mail některému ze zaměstnanců výpočetního centra. Používání Ve většině případů by umístění úložiště nuly (nastavené proměnnou prostředí GAUSS_SCRDIR) mělo být v lokálním paralelním souborovém systému klastru (poškrábání) nebo v místních souborových systémech lscratch (lscratch. V případě, že se vám nepodaří definovat tato proměnná v dávkovém skriptu bude hodnota této proměnné stejná jako PBS_O_WORKDIR, tj. adresář, ze kterého byla úloha odeslána. Před spuštěním Gaussiana musíte nastavit několik proměnných prostředí. Toho se dosáhne nejsnadněji načtením souboru Gaussovského modulu pomocí: zatížení modulu Gaussian / 16 Příklad dávkového skriptu, který lze použít jako šablonu k odeslání Gaussovských 16 úloh. bin / bash #PBS -q paralelní #PBS -l uzly = 1: ppn = 24 #PBS -l mem = 50gb #PBS -l cput = 1000: 00: 00 #PBS -N Gaussian_job # Definujte pracovní adresář, zkopírujte relevantní data a změňte adresář exportovat SCRATCH_DIR. scratch / USER / jobs / PBS_JOBID mkdir -p SCRATCH_DIR cd PBS_O_WORKDIR cp -r * SCRATCH_DIR cd SCRATCH_DIR export GAUSS_SCRDIR = SCRATCH_DIR # Načíst prostředí pro Gaussiana zatížení modulu Gaussian / 16 # Definujte počet jader a počet uzlů export NPROCS. wc -l <PBS_NODEFILE ` export NODES. uniq PBS_NODEFILE, awk 'printf (s. 0. sed' s. # Vložte uzly a jádra do záhlaví vstupního souboru echo "NProcShared = NPROCS. INPUT echo "LindaWorkers = NODES. INPUT kočka. VSTUP g16 <VSTUP. Pokud použijete výše uvedený příklad jako šablonu, nemusíte specifikovat počet jader a uzlů ve vstupním souboru, protože skript se o to postará. GaussView 6 GaussView je vizualizační program, který lze použít k otevírání Gaussovských výstupních souborů a souborů kontrolních bodů. k zobrazení struktur, molekulárních orbitálů, normálních režimů atd. Můžete také nastavit úlohy a odeslat je přímo. GaussView 6 na Atlasu Verze GaussView pro Gaussian 16 je verze 6. Chcete-li načíst a spustit GaussView v Atlasu, musíte nejprve načíst odpovídající modul Gaussian a poté zavolat GaussView: zatížení modulu GAUSSIAN / 16 gv Nezapomeňte, že pro otevření grafického okna musíte povolit předávání X11.
Linux Mint 17.1 XFCE x32.

 


Instalace programu (Guassian 16) Ahoj, Pokouším se nainstalovat program s názvem Gaussian 16 na U17. 04. Má tyto pokyny, kterým opravdu nerozumím, ale je z toho, co vím, dělá instalaci přímou. otázky: 1. Přeskočím na krok 3, mám to na USB, jak připojím USB? co to dokonce znamená? 2. Nainstaloval jsem csh (pomocí sudo apt-get install csh), když se pokusím udělat krok 4, a zadejte% řádky, co dál. UNIX Binary Gaussian 16 Revize A. 03 Pokyny k instalaci 1. Zkontrolujte, zda máte správné verze operačního systému a knihovny zařízení, jak je uvedeno v souboru se soubory na DVD G16 DVD. Poznámky k vydání najdete v 2. Vyberte skupinu, která bude vlastnit gaussovské soubory. Uživatelé, kteří budou spustit Gaussian by měl být již v této skupině, nebo by měl nechat to přidat do jejich seznamu skupin. Obraťte se na svůj systém správce, pokud potřebujete pomoc s tímto procesem. 3. Připojte disk DVD nebo určete, kam ho systém připojil automaticky. 4. Přejděte na prostředí C a nastavte prostředí g16root a mntpnt proměnné: bin / csh% setenv mntpnt "mnt / dvd. Nastaví se kamkoli je připojeno dvd. setenv g16root" g16. grp> je skupina z kroku 1. cd g16% bsd / install 6. Nyní jste připraveni ke spuštění. Uživatelé budou chtít přidat následující položky jejich soubor, pokud používají tcsh: setenv g16root "" setenv GAUSS_SCRDIR "" zdroj g16root / g16 / bsd. nastavuje běhové prostředí G16. Uživatelé Bash by měli do svého obsahu zahrnout následující. bash_profile g16root = " GAUSS_SCRDIR = " exportovat g16root GAUSS_SCRDIR. g16root / g16 / bsd / ofile v prvním příkazu je umístění adresáře g16. Pokud je například cesta k tomuto adresáři / usr / local / g16, pak nastavte g16root na / usr / local. v druhém příkazu je adresář, který bude ve výchozím nastavení použit pro soubory 16 scratchů Gaussian. Na tomto místě by mělo být dostatek místa na disku. Všimněte si, že úhlové závorky NENÍ zahrnuty. Naposledy upravil eelie; 2. května 2017 v 04:20. Re: instalace programu (Guassian 16) 1: Pokud jste neupravili svůj systém tak, aby jinak, usb by měl být připojen automaticky na / media / vaše uživatelské jméno / somelabel. Jinak musíte použít příkaz mount. Připojení je akce připojení systému souborů na usb ke kořenovému systému souborů vašeho systému Ubuntu. 2: Stačí zadat příkazy. Znak% znamená, že byste měli mít k dispozici výzvu csh. Takže nezadávejte znaky%.

Aktualizováno dne 02/10/20 15:09:28 +03: 00. Gaussian 16 binární soubory byly nainstalovány v / sw / linux / gaussian / g16. Na být schopen jej použít v klastru thinc, prosím nastavte následující prostředí proměnné ve skriptu úlohy: export g16root = sw / linux / gaussian / g16 export GAUSS_SCRDIR = usr / scratch / LOGNAME. g16root / g16 / bsd / ofile Pro interaktivní použití vložte první dva řádky do svého. profil nebo a spusťte třetí řádek v terminálu, který provozujete Gaussian in. Nezapomeňte se po změně odhlásit a znovu zapnout. profil a / nebo. Inicializační skript g16 nastavuje alias „gv“, na který odkazuje GaussView.

SimbaPoker Linux Client. Gaussian 16 je nejnovější z gaussovské řady programů. Poskytuje nejmodernější možnosti pro elektronické modelování struktur. Gaussian 16 je licencován pro celou řadu počítačových systémů. Všechny verze Gaussian 16 obsahují všechny vědecké / modelovací funkce a žádná z nich neklade žádná umělá omezení na výpočty kromě vašich výpočetních zdrojů a trpělivosti. Pro více informací prosím vyberte z následujících odkazů: O uživateli Gaussian 16 Co je nového v Gaussian 16 Poznámky k vydání Gaussian 16 Funkce v kostce Požadavky na počítač: UNIX, Linux, macOS Požadavky na počítač: Windows G16M a macOS Catalina Informace o cenách Údržba je k dispozici pro Gaussian 16 Poslední aktualizace: 14. října 2019.

I-Sensys MF8030cn 32bitové ovladače Debian Linux.